胃蛋白酶測定可用于鑒別神經性低酸癥，當過少或缺乏時，前者胃蛋白酶的含量有時正常而后者鹽酸與胃蛋白酶同時缺乏。一般認為胃性低酸癥是由于胃粘膜的重癥器質性變化所致，特別是對于惡性貧血|、無酸癥、無胃蛋白酶分泌是診斷上的重要所見。慢性胃炎、慢性胃擴張、慢性十二脂腸炎等胃蛋白酶的分泌常減少。一般胃酸基礎分泌高的疾患，如等，胃蛋白酶活性增高。1836年，(Theodor Schwann)在對消化過程進行的研究中，發現了一種能夠參與消化作用的，并將其命名為胃蛋白酶。胃蛋白酶也是第一個從動物身上獲得的酶。
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