水產科技系是江蘇省水產類專業辦學最大系部，在校生近600人，現有專任教師20名，兼職教師18名，專任教師研究生學歷達90%。近五年來，先后承擔省市教科研項目8項，編寫水產類專業教材10多部，在國內外核心期刊上發表教科研論文60多篇，獲授權專利10多項，榮獲市級及以上教科研獎項6項，擁有江蘇省水產科技成果轉化基地平臺、江蘇省漁業科普基地及江蘇省漁業培訓機構等省市研發推廣平臺6個。建有專業實訓室11個，實訓室儀器設備總值超600萬元，建成校內實訓基地2個，與光明集團、通威集團、江蘇淡水水產研究所等行業知名大型企事業單位廣泛開展緊密校企合作，90%以上學生在二年級與企業簽定就業協議，近三年來畢業生就業率100%，供求比達到1:10以上，就業質量高，薪資水平高。
水產養殖技術
培養目標：培養從事水產動物養殖、漁飼料漁藥銷售、水產養殖技術服務及管理等工作的技術技能人才。
主干課程：池塘養魚、蝦蟹增養殖、水產動物疾病防治、水產動物營養與飼料等。
就業方向：畢業生主要在水產、飼料、漁藥及科研院所等大型企事業單位就業，從事技術服務、研發、銷售及管理等工作，就業率100%，也可自主創業。
水族科學與技術
培養目標：培養從事觀賞動植物繁養、水族景觀設計與維護、水族工程設計與建設、水族產品經營管理等工作的技術技能人才。
主干課程：觀賞植物栽培學、觀賞動物繁殖與養殖、水族醫學、水族箱設計與布景、水族館創意與設計等。
就業方向：畢業生主要在大中城市的水族館、海洋館及休閑漁業公司就業，從事技術服務、研發、銷售及管理等工作，就業率99%以上，也可自主創業。
水生動物醫學
培養目標：本專業主要面向水生動物病害防控、養殖生產、教育、科研和管理等行業企業，培養擁護黨的基本路線，德、智、體、美、勞全面發展，具有良好的職業道德和法律觀念，掌握基礎獸醫學、預防獸醫學、臨床獸醫學等專業知識與技能，能從事病害防控、預防檢疫、科學研究、教學、經營管理、技術開發與推廣等崗位工作的高素質技術技能人才。
主干課程：《魚類學》、《水產微生物》、《水生生物學》、《水環境監測與保護》、《水產養殖學概論》、《水產動物營養與飼料》、《水產動物病理學》、《水產動物疾病防治》、《池塘養魚》、《特種水產養殖》等。
就業方向：畢業生主要在水產、飼料、漁藥及科研院所等大型企事業單位就業，從事技術服務、研發、銷售及管理等，就業率99%以上，也可自主創業
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