學院始建于1950年，現有臨床醫學、中醫學、中西醫臨床醫學、護理學和藥學等五個本科專業。臨床醫學、中醫學和中西醫臨床醫學三個專業學制為5年，護理學、藥學兩個專業學制為4年，其中臨床醫學專業設有婦產科學、助產學、皮膚病性病防治、麻醉與危重醫學等四類輔修課程班，辦學特色在省內外具有較高的影響。學院具有招收本科臨床醫學專業（英語授課）來華留學生資格，從2006年開始招生，采用純英文授課。學院設有中西醫結合一級學科博士學位點，基礎醫學、臨床醫學、中西醫結合、公共衛生與預防醫學、護理學、藥學、中藥學等七個一級學科碩士學位點以及臨床醫學（含全科醫學、臨床病理學、中西醫結合）、中藥學等兩個專業碩士學位點。中西醫結合一級學科為省級重點學科，消化科、神經內科、心臟內科、血液內科、婦產科、胸心外科、普外科、骨科、泌尿外科、麻醉科、醫學影像科等十五個臨床?？茷槭〖壷攸c臨床?？啤W院是衛生部腔鏡培訓中心、國家心理咨詢師職業資格培訓基地。目前，學院有全日制本科學生兩千余人，碩士、博士研究生近五百人，外國留學生本科、碩士一百余人。
學院設有基礎醫學部、臨床醫學一系、臨床醫學二系、婦產與生殖醫學系、中西醫結合學系、護理學系和藥學系，擁有江蘇省基礎醫學實驗教學示范中心、中央與地方共建臨床醫學實驗中心以及藥學綜合教學實驗室。學院擁有江蘇省蘇北人民醫院、揚州市第一人民醫院等八所臨床醫學院、十余所附屬醫院以及30余所教學實習醫院。
學院重視科學研究，近年承擔國家高技術發展計劃項目、國家重點基礎研究發展計劃項目、國家自然科學基金項目、省重大招標項目等課題70余項，取得了一批高水平的科研成果，產生了顯著的社會效益和經濟效益。學院設有《實用臨床醫藥雜志》編輯部，該雜志為全國公開發行的核心學術期刊，連續多年獲教育部“中國高校優秀期刊獎”。
學院已為國家培養各類高中級醫療衛生人才12000余人。畢業生基礎理論扎實，實踐能力較強，作風樸實，受到用人單位廣泛好評，其中一大批已成為醫療衛生行業的骨干力量。全國優秀共產黨員、勞動模范、白求恩獎章獲得者、被譽為“白衣圣人”的吳登云同志，是學院優秀畢業生的杰出代表。
| ?！I | 學制 | 培養目標 | 開設的主要課程 |
| 臨床醫學 | 五年 | 培養具備為人類健康服務的獻身精神，具備臨床醫學的基本知識、基本理論和基本技能，能在醫療衛生單位、醫學科研、預防保健等部門從事疾病診治，以及從事醫學教育、科學研究及預防保健工作的寬口徑的醫學人才。 | 開設人體解剖學、組織胚胎學、生理學、生物化學、藥理學、病理學、病原生物學、免疫學、診斷學、內科學、外科學、婦產科學、兒科學、預防醫學等學位課程及有關通修課和選修課。 |
| 中西醫臨床醫學 | 五年 | 培養適應21世紀我國衛生保健事業發展需求，具有中醫藥理論基礎、專業知識和專業實踐技能，系統掌握中醫理論體系及現代醫學知識，利用治未病理論預防疾病，具有扎實的中醫臨床思維能力、較強的臨床辨治能力，能在各級各類醫療衛生、保健機構及醫學科研機構從事中醫診治疾病和預防保健工作、開展科學研究工作的實用型中醫專門人才。 | 中醫基礎理論、中醫診斷學、中藥學、方劑學、人體解剖學、生理學、病理學、藥理學、診斷學、中西醫內科學、針灸學等學位課程及有關通修課和選修課。 |
| 護理學 | 四年 | 培養適應21世紀我國衛生保健事業發展需求，系統掌握護理學基礎理論、基本知識和基本技能，具備良好護理職業道德，具有初步的護理管理、護理教育及護理科研能力，能在各類醫療衛生、保健機構從事護理和預防保健工作的護理高級專門人才。 | 人體解剖學、生理學、生物化學、病理生理學、藥理學、護理學基礎、健康評估Ⅰ—Ⅱ、內科護理學、外科護理學、婦產科護理學、兒科護理學等學位課程及有關通修課和選修課。 |
| 藥學 | 四年 | 培養德、智、體、美全面發展，具備藥學基本理論、基本知識和基本技能，能夠從事指導藥物臨床應用、藥物生產、營銷、管理、質量控制與監測等方面工作的復合型專門人才。 | 有機化學＊、生物化學＊、生理學、藥物化學＊、天然藥物化學、藥理學＊、藥物分析＊、藥劑學＊、藥物治療學、生藥學、藥事管理與法規學位課程及有關通修課和選修課。 |
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