氨基糖苷類目前仍作為治療需氧革蘭陰性桿菌所致的嚴重感染的一類重要抗生素，如呼吸道感染、泌尿道感染、皮膚軟組織感染、胃腸道感染、燒傷或創傷感染及骨關節感染等。不同氨基糖苷類藥物之間的療效并無顯著差別。對敗血癥、肺炎、腦膜炎等革蘭陰性桿菌引起的嚴重感染，需聯合應用其他抗革蘭陰性桿菌的抗菌藥，如廣譜半合成青霉素、第三代頭孢菌素及氟喹諾酮類等，單用可能失敗。聯合用藥治療革蘭陽性菌的感染，主要用于腸球菌屬或草綠色鏈球菌所致心內膜炎，金黃色葡萄球菌與表皮葡萄球菌所致敗血病、心內膜炎等。常與耐酶青霉素、利福平或萬古霉素合用。
用于結核桿菌和非典型分枝桿菌感染，結核病可選用鏈霉素，非典型分枝桿菌感染主要選用阿米卡星。
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