第三臨床醫學院前身為浙江中醫學院針灸推拿系，迄今建院34周年，是浙江中醫藥大學三大臨床醫學院之一。目前開設五年制針灸推拿學專業、本科中醫學七年制(針灸推拿學方向)。2012年被評為浙江省“十二五”普通本科高等學校優勢專業建設項目，2014年被評為浙江省“十二五”普通本科高等學校國際化專業建設項目，2016年被評為浙江省“十三五”普通本科高等學校優勢專業建設項目。學院臨床教學基地—浙江省中山醫院屬國家中醫藥管理局首批中醫住院醫師規范化培訓基地，浙江省中、西醫住院醫師規范化臨床培訓基地和浙江省針灸推拿國際培訓中心。學院及附屬醫院師資實力雄厚?，F有教職員工823人，擁有高級職稱專家107人，其中國家教學名師1人，省級教學名師3人，衛生部有突出貢獻中青年專家1人，浙江省衛生領軍人才1人，全國老中醫藥專家學術經驗繼承指導老師6人，省級名中醫4人，博士研究生導師6人，碩士研究生導師31人，省中青年臨床名中醫4人，省醫壇新秀3人，全國優秀臨床中醫藥研修人才4人，浙江省“151人才工程”培養對象9人。學院擁有一級學科博士后流動站1個，博士學位授權點3個，碩士學位授權點11個。
學院一貫遵循“以學生為中心”的教育理念，在全國率先實行“院院合一”辦學模式，注重教學硬件設施的投入，特別是中青年教師的培養，著力提高本科教學水平和教學質量，強化理論與臨床實踐的融合，突出院校教育與經典傳承相結合的教學模式。以理論教學、校內實訓、模擬醫院、社會實踐的立體化培養模式，培養適應中醫藥事業發展及社會需求的針灸推拿應用型人才為目標。
學院建有國家級精品視頻公開課1門、國家級精品資源共享課1門、省級精品在線開放課程1門、全國中醫藥聯盟慕課1門;主編“十二五”國家級規劃教材2部、主編“十二五”行業類規劃教材8部、主編“十二五”全國中醫藥行業類英文規劃教材1部、主編并出版“十三五”全國中醫藥行業類規劃教材4部。學院學生近5年獲全國中醫藥院校針灸推拿臨床技能大賽團體二等獎3項，近三年獲浙江省“挑戰杯”大學生課外學術科技作品競賽二等獎2項、三等獎3項。
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