氨基糖苷類抗生素毒性與服藥劑量和時程有關，也隨藥物不同而異，甚至在停藥以后，也可出現不可逆的毒性反應。在兒童和老人更易引起。
1．耳毒性所有氨基糖苷類抗生素均有耳毒性，由于藥物在內耳蓄積，可使感覺毛細胞發生退行性和永久性改變。
2．腎毒性氨基糖省類是誘發藥源性腎衰竭的常見因素。
3．神經肌肉阻斷與給藥劑量和給藥途徑有關，常見于大劑量腹膜內或胸膜內應用后，出現心肌抑制、血壓下降、肢體癱瘓和呼吸衰竭，也偶見于肌內或靜脈注射后。
4．變態反應少見，可表現為皮疹、發熱、血管神經性水腫。
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